Председатель Правительства России подписал соответствующее распоряжение, который опубликован 6 марта 2020 года на сайте кабмина. Согласно данным на сайте Минтранса России, в аппарате ведомства - первый заместитель Иннокентий Алафинов, а также 7 заместителей руководителя министерства. Еще одним распоряжением Михаил Мишустин ввел в структуру Минтранса должность первого заместителя министра транспорта - руководителя Федерального агентства воздушного транспорта. Александр Нерадько возглавлял Росавиацию с декабря 2009 года. До этого с октября 2005 года он был руководителем Федеральной аэронавигационной службы.