За свою деятельность он был удостоен почётных званий «Заслуженный деятель науки Российской Федерации», «Почётный работник высшего профессионального образования РФ», имеет орден Почёта, медали «За трудовую доблесть», «За трудовое отличие». Он не раз избирался почётным членом известных научных обществ мира: Международного биологического центра Кембрижда,
Генеральной ассамблеи Польской медицинской академии, Всемирной медицинской академии им. А. Швейцера, Медицинского колледжа
города Осака (
Япония), имел множество государственных и интернациональных наград. Также Владимир Анатольевич был почётным жителем Благовещенска.