Ещё

Хромосомы пребывают на грани фазового перехода 

Хромосомы пребывают на грани фазового перехода
Фото: Индикатор
Ученые из  и Калифорнийского университета в Сан-Диего пронаблюдали подвижность сегментов ДНК в процессе VDJ-рекомбинации и обнаружили, что хроматин находися на границе фазового перехода золь-гель. Таким образом, структура упаковки ДНК в ядре может определять судьбу клетки. Исследование было опубликовано в Nature Communications.
Лимфоциты делят на Т-клетки, проглатывающие и переваривающие антигены, и В-клетки, синтезирующие белки-антитела к антигену. Антитела специфически связываются с участками возбудителей, связывают его «по рукам» и запускают последующие программы иммунитета. Один тип В-клеток вырабатывает один антител. В период созревания В-клеток формируется 109 антиген-специфичных рецепторов, что просто невозможно упаковать в клеточный геном. Поэтому в эволюции позвоночных животных развилась способность случайным образом нарезать гены антиген-специфичных рецепторов из приготовленных для этого сегментов ДНК. «Шинкуя» последовательность случайным образом, клетки охватывают все возможное разнообразие последовательностей антител.
ДНК-сегменты антител организованы в три группы, получившие названия V (variable), D (diversity) и J (joining). Результирующий ген должен содержать по одному фрагменту каждой группы. Процесс, в котором случайным образом отбираются представители каждого класса получил название соматической или VDJ-рекомбинации.
Команда ученых задалась целью понять, какую роль отдаленные геномные взаимодействия играют в VDJ-рекомбинации. Для этого исследователи анализировали движение мышиных участков ДНК V и DJ по направлению друг к другу. Результаты флуоресцентной гибридизации FISH показали, что конфигурация сегментов позволяет только локальное движение. Близкие сегменты остаются вблизи, дальние сегменты остаются вдали.
Сравнение экспериментальных и смоделированных данных позволило предположить, что ограничивает движение сеть сшивок между цепями ДНК. Трехмерный каркас характерен для так называемой фазы геля, близкой к состоянию золя — коллоидного раствора независимых цепей хроматина. Эти позволяет предположить, что пребывание хромосом вблизи фазового перехода золь-гель контролирует геномные взаимодействия, которые необходимы для контроля процессов синтеза и соматической рекомбинации.
Так структура упаковки ДНК в ядре может определять судьбу клетки.
Понравился материал? Добавьте Indicator.Ru в «Мои источники» Яндекс. Новостей и читайте нас чаще.
Тренер в США обезоружил ученика объятиями
Комментарии
Читайте также
Новости партнеров
Больше видео